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Etude de pistacia atlantica de deux régions de sud Algérien : dosage des lipides, dosage des polyphénols, essais antileishmaniens
(2008) Maamri, Sarra
La connaissance des guérisseurs traditionnels représente souvent une base pour la recherche pharmacologique et phytochimique sur les médicaments naturels. Ce travail s'est concentré en premier lieu sur l’étude comparative de Pistacia atlantica de deux régions sud - algériennes (Laghouat et Ain Oussera ) , à travers leur teneur en composés phénoliques existants dans les feuilles et les fruits et la teneur de leur fruits en lipides. Puis l’évaluation de leurs activ ité antioxydante et antileishmanienne in vitro. Les résultats obtenus reflètent une variabilité quantitative et qualitative du métabolisme des composés phénoliques des feuilles et des fruits, et celui des composés lipidiques des fruits, que se soit entre Pistacia atlantica des deux régions ou même pour les échantillons de la même région. Donc les polyphénols et les lipides constituent des caractères spécifiques pour chaque pied de Pistacia atlantica étudie ce qui Suggère que ce sont des bon marqueurs moléculaires pour l’étude biogénétique de Pistacia atlantica . Le test d’activité antioxydante montre que ces extraits phénoliques et lipidiques présentent un bon pouvoir antioxydant comparativement aux antioxydants pris comme référence. En outre il reflète tou jours la variabilité du métabolisme des antioxydants dont les pieds de Pistacia atlantica de Ain Oussera sont les plus riches en antioxydants (polyphénols, flavonoïdes, stérols, tocophérols). Un des résultats le plus important, c’est que les extraits phénoliques et lipidiques découvrent des activités antileishmaniennes à différentes concentrations vis -à-vis des formes promastigotes de deux espèces responsables de leishmanioses recensées en Algérie et dans l’ancien monde (L. Infantum : leishmaniose viscérale et L. major : leishmaniose cutanée)
Essai d'optimisation de la production d'acide lactique sur lactosérum par stroptococcus thermophilus
(2008) Boudjema, Khaled
Streptococcus thermophilus S13 est une souche de bactéries lactiques thermophiles et homolactique qui produit uniquement l'acide L (+) lactique. L'objectif de cette étude consiste en une optimisation des paramètres physicochimiques (température et pH) ainsi que le milieu de culture pour produire l'acide lactique par cette bactérie sur lactosérum doux déproteiné et stérilisé .Les analyses physicochimiques de lactosérum ont montré que ce dernier présente une qualité adéquat. La température 42°C, pH=6.42, l'adjonction de 1% d'extrait de levure et 2% de lactose ont amélioré la croissance cellulaire ainsi que la production d'acide lactique où μm = 0.412 h-1 et vm =1.095 g/l.h. Cette fermentation a suivi le modèle de Luediking et Piret où elle a mis en évidence un léger découplage entre la croissance et la production d'acide lactique
Identification de deux archaebactéries halophiles strictes isolées à partir des eaux de gisement de quelques champs pétroliers du sud Algérien et contribution à la caractérisation des biomolécules produites
(2008) Khemili, Souad
Les Bactéries halophiles extrêmes sont prédominantes dans le domaine des Archaea. Elles survivent dans les milieux à très forte concentration en sel (> 1.5M de NaCl). Actuellement, les Halobactéries présentent un grand intérêt grâce à leurs produits bioactives tel que les biosurfactants. Ces derniers ont des applications importantes grâce à leur propriété émulsifiante et activité tension active. Dans le présent travail, nous avons effectué des études microbiologiques, physiologiques et biochimiques des deux souches bactériennes halophiles A et D, leur pouvoir à produire des biopolymères à propriété émulsifiante, ainsi que l'essai de la caractérisation de ces biopolymères. D'après les résultats obtenus, la souche bactérienne A a été rapprochée au genre Halovivax et la souche bactrienne D au genre Haloarcula, au sien de la famille des Halobacteriacaea. Le biopolymère produit peut être un glycoprotéine pour la souche bactérienne A et d'un lipopeptide, glycolipide et /ou glycoprotéine pour la souche bactérienne D
Contribution à l’étude des boues de forage : isolement et évaluation de la capacité de quelques souches microbiennes à dégrader le gasoil
(2009) Akmoussi-Toumi, Siham
Cette étude a permis d’évaluer la dégradation du gasoil par des souches microbienne isolées de sols contaminés par les rejets des effluents de forage (le gasoil étant le produit majoritaire de pollution) Parmi les 6 souches isolées, deux d’entre elles ont été sélectionnées, pour leur meilleure capacité à se développer en présence de gasoil. Une identification préliminaire a révélé que l’une pouvait appartenir au genre Pseudomonas (bactérie) et l’autre au genre Rhodotorula (levure). Afin de vérifier la capacité de ces souches à dégrader le gasoil, l’étude de l’évolution de certains paramètres comme la concentration microbienne, le pH, la tension superficielle, E24 et le taux de biodégradation des nalcanes a été réalisée. Les résultats obtenus révèlent que ces souches ont une bonne croissance à des pH proches de la neutralité et ont la capacité de réduire la tension superficielle du milieu de culture à 36 mN/m. Ce résultat a été corrélé à une production de biomolécules particulières, les biosurfactants, dont la présence a bien été vérifiée et qui provoquent l’abaissement de la tension superficielle avec un index d'émulsification de 33,33% pour Pseudomonas et de 37,5 % pour rhodotorula. Les essais de biodégradation dans un milieu minéral ont montré que pseudomonas dégrade considérablement les composés n-C10, n-C12 (67.68, 40.05) et partiellement n-C11, n-C13 et n-C14 (38.53, 37.89, 30.97 %), alors que pour Rhodotorula les pourcentages de dégradation sont de 58.77% pour n-C10, 37.9% pour n-C19, 41.62% pour n-C21 et 34.39% pour le n-C23
Etude de la multiplicatoin par clonage "in vitro" du merisier (Prunus avium L.)
(2011) Mansseri née Lamrioui, Akila
Le présent travail a porté sur l’étude de la multiplication du Merisier (Prunus avium L.) par clonage in vitro. Une bonne germination in vivo est obtenue après une stratification en milieu réfrigéré (3°C), une scarification chimique et un traitement hormonal. La germination in vitro des embryons atteint un pourcentage de 100 sur milieu MS/4 avec 5 mg/l de GA3 et MS/2 avec 10 mg/l sur milieux liquides. La production des vitroplants est obtenu à partir des bourgeons prélevés sur du matériel juvénile et adulte. Les bourgeons du matériel juvénile sont très réactifs sur milieu QL. La BAP apportée aux concentrations de 2 et 4 mg/l est la cytokinine la plus appropriée pour le Merisier en phase de multiplication. Un traitement des explants à l’obscurité pendant 8 jours en présence de 1 mg/l d’AIB, les marcoéléments de MS2 dilués au cinquième donne le meilleur pourcentage d’enracinement. La culture de méristèmes atteint son maximum en présence de 6% de glucose + 1 mg/l de BAP et 0, 02 mg/l de 2.4-D. Le milieu de Murashige et Skoog (1962) enrichi avec le 2,4-D (6 mg/l) a induit une callogenèse (84,71%) à partir d’entre-noeuds. Des bourgeons néoformés et des embryons somatiques ont été obtenus sur milieu enrichi en BAP et 35% se sont développés en jeunes plantules
Etude des popupation du genres aspergillus et penicillium et de leurs mycotoxines isolees des epices et des legumes secs
(2011) Azzoune, Nadia
L'objectif de ce travail est d'étudier les moisissures qui contaminent les épices et les légumes secs commercialisées en Algérie et d'évaluer le pouvoir producteur d'aflatoxines (AFs) et d'ochratoxine A (OTA) des isolats appartenant aux genres Aspergillus et Penicillium. Un total de 70 échantillons (44 échantillons d'épices et 26 échantillons de légumes secs) a été prélevé dans différents points de vente de quatre villes d'Algérie (Biskra, Batna, Alger et Oran). L'analyse de la flore fongique a montré une nette dominance du genre Aspergillus (56,4%), suivie du genre Penicillium (25,2%), le reste des autres genres de la flore fongique est de 18%. Les principales espèces isolées appartiennent aux sections Flavi, et Nigri du genre Aspergillus, ces deux dernières étant les plus dominantes avec 28,9% et 25% respectivement du total d'Aspergillus.L'étude du pouvoir producteur d'aflatoxines des 252 isolats testés a révélé un pourcentage d'isolats aflatoxinogènes de 38 ,9% sur CCM. La production d'aflatoxines varie considérablement d'un isolat à l'autre. La quantification de l'aflatoxine B1(AFB1) par HPLC a révélé des quantités allant de 8,66 à 15313,22 µg/kg du milieu CAM. Par ailleurs, l'analyse par chromatographie sur couche mince a montré que 9,6% des isolats d'Aspergillus et de Pénicillium produisent l'ochratoxine A (OTA) sur un totale de 146 isolats. Le dosage de l'AFB1 dans 25 échantillons (21échantillons d'épices et 4 échantillons de légumes secs) a permis de détecter des quantités allant de 0,08 à 24,34 Àg/kg dans 13 échantillons d'épices (61,9%), cependant l'analyse des échantillons des légumes secs a révélée une absence totale de l'AFB1
Optimisation de la production de la protéase de Rhizopus stolonifer sur milieu solide : purification et caractérisation
(2011) Gais, Soumeyya
Le but de cette présente investigation est la production, la purification et l’étude de certaines propriétés de la protéase de Rhizopus stolonifer en vue de son utilisation dans la coagulation du lait. L’étude de l’influence de certains paramètres sur le taux de production de la protéase a été réalisée. Il a été constaté que la température optimale de production de la protéase de Rhizopus stolonifer est de 28 °C, son pH optimum est de 6, la taille optimale de l’inoculum est de 2 x 106 spores /ml, le taux d’humidité optimal du son de blé est de 50.6%, la quantité du son de blé optimale est de 10 g et le temps d’incubation optimale est de 96 heures. L’addition de certaines sources de carbone et d’azote au son de blé pour l’amélioration de l’activité coagulante de notre protéase, nous a permis de noter que la meilleure source de carbone et d’azote sont le galactose { 10% et la peptone { 1% respectivement. La purification de la protéase par précipitation au sulfate d‘ammonium à 80% suivie d’une chromatographie par filtration sur gel sephadex G100 a permis de déceler un rendement en activité de la protéase de 9.25%, un facteur de purification de 19.2 avec une activité spécifique de 2850,7 U/mg et un poids moléculaire de 41.4 ± 1.00 kDa. La vérification de l’homogénéité de la protéase de R. stolonifer par électrophorèse en conditions dénaturante a révélée un poids moléculaire de 42.96 ± 1.00 kDa. La caractérisation de la protéase de R. stolonifer a révélé que sa température optimale d’activité coagulante est de 50°C et que sa stabilité est notée aux températures 30 à 45°C. Son pH optimum est de 5.5 et que l’extrait purifié est stable pendant 24 h { 4 °C dans le tampon citrate phosphate. L’étude de l’effet de la concentration en extrait purifié et en chlorure de calcium sur l’activité coagulante de la protéase de R. stolonifer montre que l’augmentation de son activité coagulante est proportionnelle à leurs concentrations respectives. L’extrait purifié de R. stolonifer préserve mieux son activité coagulante au cours de la conservation par congélation à -18°C comparativement à la réfrigération à 4°C. L’inhibition de l’activité coagulante de l’extrait purifié par la pepstatin A à 71%, nous oriente vers la possibilité de la présence d’un groupement aspartyl dans le site actif de la protéase de R. stolonifer
Optimisation des procédés d'extraction de l'huile essentielle du thym et activité antimicrobienne
(2011) Belkheir, Meriem Bélilia
Les plantes sont capables de produire des substances naturelles très diversifiées, qui peuvent être très utiles pour l'Homme. Parmi ces substances on cite les huiles essentielles. Notre étude a pour but ; d'une part, l'optimisation paramétrique par l'utilisation des micro-ondes, de l'extraction de l'huile essentielle d'une plante aromatique très répandue en Algérie et très utilisée par les populations locales pour ses vertus médicinales, il s'agit de Thymus pallescens de Noé originaire d'Ain Defla ; d'autre part, la détermination de l'activité antimicrobienne de cette huile. Quatre procédés d'extraction ont été appliqués dans ce travail ; l'Entraînement à la Vapeur d'eau (EV), l'Entraînement à la Vapeur d'eau assisté par Micro-ondes (EVMO), l'Hydrodiffusion (HDiff) et l'Hydrodiffusion assistée par Micro-ondes (HDiffMO). Les résultats de l'optimisation de l'extraction ont montré que les procédés par microondes semblent être les meilleurs du point de vue duré d'extraction (quelques minutes contre 30 min ou plus pour les techniques conventionnelles), les micro-ondes offrent aussi l'avantage de la réduction de la consommation de l'eau et de l'énergie. Les quatre types d'huiles essentielles ont été caractérisés par leur composition chimique grâce à des analyses par CG et CG/SM ; le carvacrol est le constituant majoritaire. Il n'ya pas de différences significatives entre la composition chimique des huiles obtenues à partir des méthodes assistées par micro-ondes et des huiles obtenues par les procédés conventionnelles. La deuxième partie de ce travail montre que les huiles essentielles de Thymus pallescens sont efficaces sur les 12 souches microbiennes testées
Extraction et caractérisation des alcaloïdes quinolizidiniques de Cytisus triflorus l'Hérit et l'étude de leurs activités antimicrobienne et antioxydante
(2012) Chebili, Siham
Notre étude porte sur les alcaloïdes quinolizidiniques de Cytisus triflorus l'Hérit. Cette dernière est connue pour son utilisation traditionnelle dans la région d'Azazga (Algérie) comme plante cicatrisante et dans le traitement de certaines dermatoses. Dans ce sens, une technique d'extraction assistée par les ultrasons est appliquée. L'effet des ultrasons est évalué par rapport aux rendements et au durées d'extraction. L'étude est précédée par une étape préliminaire à fin de sélectionner une méthode conventionnelle d'extraction plus rentable. Les méthodes conventionnelles d'extraction des alcaloïdes quinolizidiniques par un solvant polaire et en milieu acide nous ont donné des rendements de 0,26% et 0,73% respectivement. Dans un deuxième temps, une extraction assistée par ultrasons est réalisée par deux modes de sonication : par sonde et avec un bain à ultrason en milieu acide. L'extraction est menée aussi par bain à ultrasons en utilisant comme solvant un mélange méthanol/acétonitrile (80/20 ; v/v). Les rendements d'extraction sont de 1,83%, 1,10% et 0,95% respectivement. Une cinétique est réalisée où les rendements maximaux sont de 1,16% après 20 min de sonication par sonde ultrasonique, ce rendement est abouti après 90 min de sonication par le bain à ultrasons. Par ailleurs, le renouvellement du solvant d'extraction augmente le rendement obtenu par le bain à ultrasons. Des variations qualitatives et quantitatives de la composition alcaloïdique quinolizidiniques de C. triflorus, en fonction de plusieurs facteurs naturels, sont mises en évidence par CCM et à partir des rendements d'extraction. Nos résultats montrent que l'automne est la saison où le rendement en alcaloïdes est plus élevé, tandis que la teneur en alcaloïdes est plus importante dans les organes jeunes de la plante. Les feuilles de C. triflorus montrent par ailleurs un rendement en alcaloïdes plus élevé que les tiges notamment à l'état sec. Plusieurs alcaloïdes quinolizidiniques sont identifiés par CCM, selon leurs rapports frontaux. Une analyse par CPG/SM d'une fraction alcaloïdique semi-purifiée par CCM préparative a confirmé la présence de la spartéine. L'effet antimicrobien de l'extrait d'alcaloïdes quinolizidiniques des feuilles sèches de C. triflorus récoltée en hiver est plus prononcé pour les bactéries (Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Klebsiella pneumoniae et Escherichia coli). Les CMI sont comprises entre 8,33 et 66,66 µg/mL. Pour les champignons, certains d'eux ont montré une résistance (Aspergillus flavus, Fusarium culmorum et la levure Candida albicans), part contre Aspergillus carbonarius et Botrytis fabae ont révélé une sensibilité notable. Le test du pouvoir antioxydant montre que cet extrait d'alcaloïdes quinolizidiniques présente un bon pouvoir antioxydant 1,71 fois plus élevé que l'acide ascorbique
Exploration moléculaire des dystrophies musculaires en Algérie
(2012) Keskas, Sabiha
Face à des outils moléculaires de plus en plus puissants et pointus, l'exploration des maladies héréditaires chez l'homme suscite un intérêt sans cesse croissant. Malheureusement, les moyens disponibles actuellement dans notre pays ne sont pas à la hauteur des aspirations des biologistes, médecins et patients pour pouvoir mener de front cette bataille contre ces maladies invalidantes, voire pour certaines létales. Les dystrophies musculaires en sont une parfaite illustration puisque déjà poignent à l'horizon des approches thérapeutiques variées visant à stopper ou faire régresser la maladie chez des patients atteints des dystrophies musculaires de Duchenne/Becker (DMD/BMD). Dans notre contexte, nous nous sommes ainsi intéressés à explorer au plan moléculaire un peu plus d'une centaine de patients Algériens présentant l'une ou l'autre de ces deux affections, et ce par criblage du gène DMD, localisé en Xp21.2 et codant la protéine dystrophine, en utilisant une approche de deux PCRs multiplexes visant à mettre en évidence de larges délétions intragéniques dans ce gène. Nous avons ainsi pu poser une étiquette moléculaire de dystrophinopathie pour près de 70% des malades, avec caractérisation fine de l'altération génétique en cause dans leur maladie, soulignant toute la pertinence de notre approche d'investigation et suggérant la forte prévalence de ces deux affections neuromusculaires dans notre population. D'autre part, l'analyse des données générées expérimentalement nous a permis de connaître précisément dans le gène DMD les régions exoniques altérées par les mutations chez ces patients, autant que l'étendue de ces anomalies et la mise en évidence de l'implication préférentielle d'un site mutationnel "hot-spot", le site P20, en position distale par rapport au gène. Egalement, l'utilisation combinée d'analyses bioinformatiques nous a ouvert l'opportunité de caractériser avec exactitude l'effet délétère potentiel que ne manquaient pas de créer les délétions intergéniques identifiées chez les malades, esquissant d'intéressantes corrélations phénotype/génotype en vue d'un diagnostic différentiel entre les deux formes alléliques DMD et BMD. Le présent travail que nous avons réalisé souligne la faisabilité et la puissance de l'approche diagnostique que nous avons suivie, une démarche assez simple à mettre en place dans un laboratoire de biologie moléculaire, reproductible, précise et d'un coût relativement modéré, arguments qui en font une méthode de choix pour explorer les dystrophinopathies dans notre pays, pour contribuer à une meilleure connaissance de sa composante génétique et qui laissent entrevoir son utilisation dans le cadre d'une meilleure prise en charge des malades et dans la mise en œuvre d'un conseil génétique éclairé à l'attention des familles qui en sont demandeuses
Optimisation de la production de la protéase acide par aspergillus niger sur milieu solide : purification et caractérisation
(2012) Bensmail, Souhila
La pénurie mondiale en présure à susciter le développement de la recherche des nouveaux succédanés capables de coaguler le lait, tout en assurant de bons rendements fromagers. Dans cet objectif, la production de la protéase acide extracellulaire par l’espèce fongique Aspergillus niger isolée localement, sur un résidu agroalimentaire peu couteux fermenté par des cultures solides (SSF), a été optimisée de façon à obtenir la meilleure activité coagulante. Un essai de purification et une caractérisation biochimique de l’enzyme ont été également effectués. Les résultats obtenus montrent que la meilleure production de cette enzyme (830 US/g avec un rapport AC/AP de 4,25) a été obtenue sur milieu à base de son de blé (10g), humidifié à un taux de 39,21% par une solution minérale Czapek-Dox à pH 4, incubé à 30°C pendant 72 heures et inoculé par la suspension fongique de 106 spores/ml. L’application du plan factoriel fractionnaire à l’optimisation de la production de la protéase acide d’A. niger, a permis de déterminer l’influence significative du taux d’humidité du substrat et de la quantité en CaCl2 dans le milieu (deux effets contradictoires positif et négatif respectivement) et d’exclure l’importance des autres facteurs du plan d’expérience (la quantité du lait écrémé et celle de la caséine). Une activité coagulante de 582 US/g et un rapport AC/AP de 4,32 ont été obtenus pendant cette étude. La protéase extracellulaire a été purifiée 8 fois avec un rendement d’environ 10%, en utilisant la précipitation au (NH4)2SO4 à 80% de saturation et la chromatographie échangeuse d'ions sur DEAE-A50. La purification était plus efficace dans ces conditions par rapport à l'utilisation de la chromatographie d'exclusion moléculaire sur gel de Sephadex-G100 comme l’étape qui suive la précipitation. L'enzyme a été trouvée sous une forme monomérique, ayant un poids moléculaire de 47,7kDa par SDS-PAGE, résultats confirmés par la zymographie. Les conditions optimales de l’activité coagulante de l’extrait enzymatique partiellement purifié ont été déterminées ; elles correspondent aux paramètres suivants: température de 45°C, pH 5 (protéase acide) et une concentration en CaCl2 de 0,04M. Il présente une stabilité dans la gamme du pH 3,0-5,0 à 4°C pendant 24 heures dans le tampon citrate de sodium (0,1M) et une stabilité thermique jusqu’à 45°C pendant 1 heure
Alcaloïdes et polyphénols d'Haplophyllum tuberculatum (Forssk) : effet antimicrobien
(2012) Djouahra-Fahem, Djamila
Notre travail a eu pour objectifs d’évaluer l’activité antimicrobienne et antioxydante des polyphénols et des alcaloïdes d’Haplophyllum tuberculatum : plante récolté du désert algérien. Elle est traditionnellement utilisée pour traiter les maux de tête, le ballonnement du ventre, l’arthrite, mais aussi contre les infections et les maladies parasitaires. Nous avons procédé durant notre étude à une caractérisation des deux substances bioactives extraites puis à un criblage biologique. La caractérisation a été faite par la CCM. , cette analyse a permis la mise en évidence de traces de la quercitine et de la rutine dans l’extrait polyphénolique total et les alcaloïdes se sont représentés par des taches orange après révélation par le réactif de Dragendorff. Tandis que le criblage biologique, il s’est représenté par les activités antimicrobienne, antifongique et antioxydante. Les tests antimicrobiens à base des extraits polyphénoliques et alcaloïdiques de la plante ont montré une activité moyenne sur quelques souches bactériennes testés à savoir Bacillus subtilis ATCC 6633 , Staphylococcus aureus ATCC 25923 ,et Pseudomonas aerginosa ATCC 27953 ; avec des CMI variantes de 0,625 mg/ml à 10mg/ml pour les alcaloïdes et de 5mg/ml à 20 mg/ml pour les polyphénols .Cependant les souches fongiques testés Aspergillus flavus NRRL 3251T , Aspirgillus parasiticus CBS 100926T, Aspirgillus fumigatus et Mucor sp. ont été toutes résistantes. L’activité antioxydante a été évaluée avec le test de blanchissement de B- carotène et le test du pouvoir réducteur, les deux substances ont présenté une bonne activité antioxydante avec une meilleure activité des polyphénols par rapport aux alcaloïdes
Etude des champignons aflatoxinogenes et ochratoxinogenes isoles des fruits secs et des graines de sesame : influence de la temperature et l'activite de l'eau sur la production de l'aflatoxine B1
(2012) Ait Mimoune, Nouara
Dans notre travail on s'est intéressé à l'étude de la contamination fongique de 57 échantillons de fruits secs et graines oléagineuses (amandes, pistaches et graines de sésame) collectés dans différentes régions d'Algérie. Le dénombrement et l'identification de la flore fongique totale a démontré la dominance du genre Aspergillus (84,69%) suivi du genre Penicillium (9,31%). A partir de ces échantillons, 233 souches d'Aspergillus et 15 souches de Penicillium ont été isolées et testées pour leur capacité à produire les aflatoxines et l'ochratoxine A (OTA). Le potentiel toxinogène de ces différentes souches fongiques a été caractérisé sur milieu CAM pour les Aspergillus section Flavi et sur milieu CYA pour les autres isolats. La détection de la production des mycotoxines a été réalisée par CCM. Les résultats obtenus montrent que sur les 33 isolats d'A. carbonarius 93,93% sont ochratoxinogènes et aucun des isolats d'Aspergillus niger (105 isolats), d'Aspergillus ochraceus (4 isolats) et de Penicilliuim sp (15 isolats) ne produit l'OTA. Pour les 91 isolats d'Aspergillus appartenant à la section Flavi, 88 ont été identifiés comme étant des A. flavus et 3 sont rattachés à A. parasiticus. Ces dernières sont hautement aflatoxinogènes et produisent l'aflatoxine B et G. Pour les A. flavus 34,09% se sont révélés aflatoxinogènes et produisent l'AFB1 uniquement. La production de CPA et de sclérotes a été réalisée sur milieu CYA. Toutes les souches aflatoxinogènes d'A. flavus produisent le CPA alors que 29,2% ont produit des sclérotes de type " L ". Une étude portant sur l'influence de la température et de l'activité de l'eau (aw) sur la croissance et la production d'AFB1 d'une souche d'A. flavus aflatoxinogène a été également réalisée. Nous avons remarqué que l'humidité affecte sensiblement la production d'AFB1 par A. flavus. Une production optimale d'AFB1 a été détectée à 30°C et à une aw de 0,99
Prédiction des épitopes B de l'allergène Der p 5 et étude in silico de la structure et de l'état oligomérique des allergènes d'acariens des familles 5 et 21
(2013) Khemili, Souad
Cette recherche s'inscrit dans le cadre de l'étude in silico (en utilisant des approches bioinformatiques et de modélisations moléculaires) des structures 3D des allergènes d'acariens de poussières de maisons des familles 5 et 21. Nous avons pour objectifs de définir les épitopes de Der p 5 et de fournir des informations quant à leur propension à dimériser. Cela contribue à l'étude de leurs mécanismes d’allergénicité et pourrait aboutir à la conception de variants hypoallergéniques pour l'immunothérapie. Quatre régions antigéniques ont été identifiées pour Der p 5: H34-L39 (épitope-Nt), H58-D69 (épitope II), L92-E107 (épitope I) et K129-V132 (épitope-Ct) (selon la numérotation du code PDB 3MQ1 de Der p 5). Par la suite, les résidus situés dans ces régions qui pourraient jouer un rôle crucial dans la liaison aux immunoglobulines E (IgE) ont été sélectionnés selon des critères que nous avons définis (nature des acides aminés et leur accessibilité au solvant) pour la validation expérimentale. Par ailleurs, nous avons étudié la propension des allergènes Der f 5 et Der f 21 de Dermatophagoides farinae, Der p 21 de Dermatophagoides pteronyssinus, Sui 5 m de Suidasia medanensis et Lep d 5 de Lepidoglyphus destructor et Blo t 21 de Blomia tropicalis à dimériser et former une grande cavité hydrophobe similaire à celle de Der p 5. Cette cavité hydrophobe a été suggérée dans la littérature comme pouvant intervenir dans l'initiation du processus allergique en liant certains ligands hydrophobes. Nos résultats suggèrent que seulement Der f 5 pourrait former un dimère semblable à Der p 5. Les autres allergènes (Blo t 5, Sui 5 m, Lep d 5, Der p 21, 21 et Der f Blo t 21) ne présentent pas une telle propension. En outre, nous avons identifié des mutations qui devraient déstabiliser et/ou entraver la formation de la structure dimérique de Derp5, ce qui pourrait aider à la compréhension du rôle du processus de dimérisation dans la réponse allergique de ces allergènes
Etude de la biodiversité microbienne dans les écosystèmes aquatiques pétroliers
(2014) Lenchi, Nesrine
Les micro-organismes habitant de nombreux gisements pétroliers sont des multiextrêmophiles capables de survivre dans des environnements ou règne de hautes températures, pressions et salinités. Leurs activités influencent la qualité du pétrole et sont aussi un important réservoir d’enzymes d'intérêts industriels. Afin d’étudier la composition de cette communauté microbienne et évaluer les modifications qui pourraient être causées par les pratiques industrielles, les communautés bactériennes et archéennes présentent dans les eaux de quatre champs pétrolifères algériens ont été décrites et comparées. Trois différents types d'échantillons ont été analysés : les eaux de production de puits touchés par les eaux d’injection, les eaux de production non touchées par les eaux d’injection et des eaux d’injection. Les communautés microbiennes des eaux de production semblent être sensiblement différentes de celles des eaux d'injection. D'un point de vue quantitatif, les eaux d'injection abritaient environ dix fois plus de cellules microbiennes que les eaux de production. Les bactéries dominent dans les eaux d’injection, tandis que les archées dominent dans les eaux de production. L'analyse statistique basée sur l'abondance relative et la composition de la communauté bactérienne (CCB) a révélé des différences significatives entre les eaux de production et les eaux d’injection aussi bien au niveau OTUs0.03 qu’au niveau phylum. Toutefois, aucune différence significative n'a été retrouvée entre les eaux de production touchées ou non touchées par les eaux d’injection, ce qui suggère que la plupart des micro-organismes introduits par l'eau d'injection ont été incapables de survivre dans les eaux de production. En outre, un diagramme de Venn généré pour comparer la CCB d’une eau de production avec son eau d’injection a révélé que seulement 4% des OTUs bactériennes sont communes à ces deux types d’eaux. L'analyse phylogénétique des séquences bactériennes indiquait que Alpha, Beta et Gammaproteobacteria étaient les principales classes retrouvées dans la plupart des échantillons d'eaux. Les séquences d'archées ont été obtenues seulement à partir des eaux de production et chaque puits avait une composition unique en communauté archaeal, appartenant principalement aux classes des Methanobacteria, Methanomicrobia, Thermoprotei et Halobactéries. Plusieurs genres bactériens recensés avaient déjà été rapportés comme dégradeurs de molécules et de polluants organiques complexes. Néanmoins, un grand nombre de séquences de bactéries et d'archées non classées ont été retrouvés dans ces échantillons analysés, ce qui indique que les eaux souterraines des champs pétrolifères pourraient abriter de nouvelles espèces microbiennes non encore décrite jusqu'à l’heure actuelle
Caractérisation biochimique et moléculaire des pseudomonas spp. fluorescents : etude de leurs potentialités dans le contrôle de verticillium dahliae Kleb
(2016) Tihar-Benzina, Farida
Notre thème de recherche s'insère dans le cadre de la lutte biologique qui peut être considérée comme une alternative potentielle à la lutte chimique. Les études que nous avons menées visent dans un premier temps à l'isolement et l'identification d'un champignon vasculaire Verticillium dahliae, agent de la verticilliose vasculaire de plusieurs plantes cultivées. Dans un second temps, ces études sont complétées par la recherche et la sélection des bactéries de groupe des Pseudomonas spp. fluorescents en vue de leur utilisation contre ce phytopathogène. Les prospections effectuées durant la compagne agricole 2012-2014 dans plusieurs oliveraies situées à Boumerdes, Bouira et Tizi ouzou montrent la présence de maladies fongiques dont la verticilliose vasculaire. Quinze souches sont isolées et identifiées selon leurs caractéristiques culturelles et phénotypiques comme étant Verticillium dahliae. Ces souches sont divisées en deux pathotypes selon leurs profils génétiques en se basant sur l'utilisation d'amorces spécifiques de pathotype défoliant (D) et non défoliant (ND). L'étude de l'influence des paramètres physiologiques sur la croissance mycélienne in vitro montre que les isolats de V. dahliae ont une croissance optimale sur le milieu V8 agar et PDA pour un pH compris entre 5 et 8 (5 < pH < 8) et sous une température de 25°C. L'alternance de 12h de lumière et 12h d'obscurité influence la croissance et l'aspect cultural des différentes souches de V. dahalie. Le pouvoir pathogène des clones du phytopathogène testé par inoculation artificielle de plants de tomate variété Marmande permet d'estimer les indices d'altérations foliaires, les indices de rabougrissements ainsi que le brunissement du système vasculaire. Les symptômes observés (rabougrissement, flétrissure du feuillage, jaunissement et chute des feuilles) ont mis en évidence un pouvoir pathogène trop élevé des souches isolées des oliveraies de Bouira et de Tizi ouzou par rapport à celles de Boumerdes. Les isolats de bactéries antagonistes sélectionnés sont criblés à l'aide du test d'antagonisme in vitro et in situ. Les cinq isolats retenus ont significativement réduit la croissance mycélienne et la formation de microsclérotes de V. dahlaie. L'efficacité des souches retenues est ensuite évaluée en pots sous serre; l'incidence du flétrissement verticillien est ralentie après la bactérisation des racines des plants de tomate. La capacité des deux meilleurs isolats de Pseudomonas T34 et T49 de protéger la tomate contre l'invasion de ce champignon a été confirmée. Un effet PGPR relatif a été relevé ; surtout dans les dernies stades de la culture. L'identification génétique des meilleurs isolats de Pseudomonas par séquençage de l'ARN 16S nous a permis de confirmer l'hétérogénéité de notre collection. Quatre principaux groupes sont définis : le groupe apparenté à P. fluorescens, P. Putida, P. azotoformans et le groupe apparenté à P. plecoglossicida. Ces souches sont caractérisées par la production de certains métabolites secondaires impliqués dans la lutte biologique contre le V. dahalie tels que les sidérophores, l'HCN, les phosphatases, le CWDE et d'autres composés antimicrobiens. Les résultats suggèrent que les phénazines (PCA, PCN) pourraient être impliqués dans l'inhibition de la formation des microsclérotes. Une nouvelle souche autochtone de Pseudomonas spp. T34 provenant de la rhizosphère de tomate est identifiée. Les souches sélectionnées sont d'excellents candidats pour contrôler V. dahliae, une vraie menace qui affecte diverses cultures, économiquement importantes dans l'agriculture Algérienne
Valorisation du lactosérum pour production de biocarburant (Bioéthanol)
(2016) Boudjema, Khaled
Le bioéthanol est considéré aujourd'hui comme une source d'énergie renouvelable de futur. L'objectif de notre travail est la production de ce métabolite sur lactosérum doux, préalablement traité, par des souches de levures isolées à partir du sol et du raisin d'origine Algérienne. D'abord, avant de lancer la fermentation alcoolique, le lactose, sucre majeur du lactosérum, a été hydrolysé enymatiquement par la ?-galactosidase en sucres fermentescibles glucose et galactose. Ensuite, la fermentation en batch a été conduite suivant le plan composite centré pour étudier les effets de la température (25 à 35°C), du pH (3,5 à 6,5) et de la concentration d'extrait de levure additionnée (0,5 à 1,5 % (p/v)) sur le rendement de la production de bioéthanol. Enfin, le bioéthanol a été produit dans les conditions optimales obtenues. Les résultats des analyses physicochimiques et biochimiques du lactosérum a permis de mettre en évidence la richesse de ce dernier en substances nutritives ; protéines (3,56 ± 0 ,02 g/l), lactose (58,50 ± 0,50 g/l) et sels minéraux (Na = 0,734 ± 0,014, Ca = 1,590 ± 0,005, K = 0,082 ± 0,002, Zn = 0,001 ± 0,000 Mg = 0,186 ± 0,006, P = 0,858 ± 0,008, Cl =1,611 ± 0,090). Ceci le permet d'être un milieu adéquat pour la croissance microbienne ainsi que la production de bioéthanol. De plus, l'étude de l'efficacité de la ?-galactosidase produite par Kluyveromyces marxianus DIV13-247, souche isolée à partir du lait de vache et identifiée par méthode biochimique et moléculaire, a donné un bon taux d'hydrolyse du lactose en atteignant 80 % au bout de 12 h. Par ailleurs, quatre souches de levures isolées se sont révélées être les meilleures productrices de bioéthanol. Elles sont identifiées par méthode biochimique et moléculaire comme étant: Hansianospora oportunie DIV13-Z087A0VS, Candida tropicalis DIV13-Z087B0VS, Saccharomyces cerevisiae DIV13-Z087C0VS et Candida tropicalis DIV13-Z087D0VS. Parmi elles, Saccharomyces cerevisiae DIV13-Z087C0VS semble être la plus résistante à l'éthanol jusqu'à une concentration de 14 % (v/v). En outre, les résultats de l'optimisation de la fermentation alcoolique par cette souche ont montré que les valeurs optimales de la température, du pH et de la concentration d'extrait de levure additionnée sont respectivement 28,38 °C, 4,31 et 0,4 % (p/v). Sous ces conditions optimales, la fermentation en batch a donné une meilleure production où la concentration d'éthanol a atteint à 18,31 g/l sur lactosérum et à 64 g/l sur le perméat de lactosérum à 20 % (p/v)
Surveillance et contrôle des leishmanioses dans le nord de l’Algérie
(2018) Bennai, Kahina
Les leishmanioses, parasitoses transmises exclusivement par les phlébotomes, constituent un vrai problème de santé publique en Algérie. Le but de ce travail est la surveillance et le contrôle de ces maladies dans le Nord d’Algérie sous leurs différents aspects. Dans un premier volet, nous avons contribué à l’amélioration du diagnostic de leishmaniose cutanée (LC), par introduction de techniques moléculaires. Quarante-neuf patients suspects de LC ont été diagnostiqués par techniques parasitologiques (examen direct, culture), sérologiques (IFI et WB) et moléculaires (PCR kinétoplastique et PCR-ITS1-RFLP). La PCRk a montré son apport flagrant dans le diagnostic de LC, avec un taux de positivité de 89.79 % et de sensibilité de 90 % plus élevés par rapport aux autres techniques réalisées. En outre, la PCR-ITS1-RFLP avait l’avantage d’identifier L. major et L. infantum chez 25 patients de LC. Nous suggérons l'utilisation de la PCRk et PCR-ITS1-RFLP pour le diagnostic et l'identification simultanée des espèces dans un contexte épidémiologique en Algérie. Dans un second volet, nous avons contribué par une étude entomo-épidémiologique à l’étude de la faune de phlébotomes, leur taux d'infection par Leishmania spp. et la détermination de leur préférence trophique dans un foyer hypoendémique de leishmaniose humaine située à Tipaza, au nord d'Algérie, par outils moléculaires. Sept espèces de phlébotomes ont été inventoriées, appartenant au deux genre Phlebotomus et Sergentomyia. P. (L.) perniciosus, P. (L.) perfiliewi et P. (L.) longicuspis, vecteurs de L. infantum au nord d’Algérie, étaient les plus abondantes dans notre collecte. Les espèces : P. (L.) langeroni ; P. (L.) ariasi ; S. (S.) minuta et P. (P.) papatasi sont peu représentées dans notre collecte. De plus, L'ADN de L. infantum a été détecté dans 3 parmi les 740 femelles de phlébotomes testées avec un taux d’infection de 0,33% chez P. (L.) perniciosus et de 2,56% chez P. (L.) perfiliewi. Enfin, l'analyse moléculaire du repas sanguin chez 88 spécimens a révélé que le sang humain (17%) était la deuxième source d'alimentation des phlébotomes du sous-genre Larroussius après les ruminants (74,11 %%). Ces résultats surlignent les facteurs de risque de transmission de L. infantum dans la province de Tipaza. En dernier volet, nous avons recherché les phlébovirus et les bactéries associés aux phlébotomes. Nos résultats révèlent l’absence de Toscana virus et Sand Fly Sicilian Virus chez les phlébotomes collectés à Bougaa (Sétif, Algérie) et rapportent pour la première en Algérie, la présence de l’ADN des Anaplasmataceae chez les phlébotomes collectés à Bourkika, Tipaza
Evaluation de l’effet des flavonoïdes extraits de borago officinalis L.sur rhipicephalus sanguineus, archeopsylla erinacei et ctenocephalides felis
(2018) El Haddad, Djillali
Le present travail, a comme objectif dپfevaluer lپfactivite acaricide et insecticide des flavonoides extraits dپfune plante medicinale (Borago officinalis L.), largement repandue au Nord de lپfAlgerie, comme alternative aux molecules chimiques, utilisees dans la lutte contre les ectoparasites hematophages des animaux domestiques. Les tests sont effectues sur la tique de chien Rhipicephalus sanguineus, la puce de chat Ctenocephalides felis et la puce du Herisson Archaeopsylla erinacei, vehiculant des maladies systemiques est vectoriels graves, surtout avec la resistance accrue que presentes ces arthropodes aux pesticides chimiques. Un screening phytochimique a ete effectue sur la plante Borago officinalis L. montrant la richesse de la Bourrache en metabolites secondaires notamment les flavonoides, les alcaloides, les tanins totaux, les tanins galliques, les glucosides et le mucilage. Lپfextraction des flavonoides a donne un rendement de 22 % pour lپfextrait aqueux et 4,87 % pour lپfextrait dپfacetate dپfethyle avec une concentration en flavonoides de192,12 پ} 0,98 et 120,99 پ} 0,81 ƒتg eq Q/g dپfextrait respectivement. Lپfanalyse spectrometrique par infrarouge montre que ces extraits presentent des molecules a fonctions variees notamment les fonctions phenol, alcene, aldehyde et ester. La caracterisation chromatographique par HTPLC revele la presence de la kaempferol, la quercetine, lپfacide gallique et lپfacide vanillique dans lپfextrait aqueux et la rutine, la rhamnetine et la cyanidine-3-glucoside dans lپfextrait de lپfacetate dپfethyle. Pour les deux extraits testes, une meilleure activite acaricide a ete obtenue sur tous les stades de developpement de la tique R. sanguineus induisant un blocage de la ponte des oeufs de 19,0328 پ} 7,2766 pour lپfextrait aqueux et 34,0673 پ} 0,0778 pour lپfextrait dپfacetate dپfethyle avec une efficacite importante sur la fertilite des oeufs de 43,12 پ} 4,26 % et 60,51 پ}1,29 % respectivement. De plus, ces extraits sont montres tres toxiques vis-a-vis les larves nouvellement eclos de R. sanguineus avec des valeurs de CL50 de 7,58mg/ml et 7,46 mg/ml pour lپfextrait aqueux et lپfextrait dپfacetate dپfethyle respectivement. Lپfactivite insecticide des flavonoides de la Bourrache montre que lپfextrait aqueux presente une activite legerement superieure par rapport a lپfextrait dپfacetate dپfethyle sur les deux especes de puces C. felis et A. erinacei, avec des valeurs de CL50 de 9,61 et 8,37 mg/ml et de 11,24 et 9,74 mg/ml respectivement. Lپfextrait dپfacetate dپfethyle a presente une cinetique de mortalite beaucoup plus prolongee dans le temps par rapport a lپfextrait aqueux donnant des valeurs de TL50 de 7,29h sur A. erinacei et 8,51h sur C. felis et de 3,99h et 4,55h pour lپfextrait aqueux sur les memes especes respectivement
Caractérisation de la relation chémotypes de l’ortie- bactéries vectorisées associées et évaluation de leurs activité sur culex sp
(2018) Toubal, Souheyla
Le présent travail s’articule autour de deux axes, l’un porte sur la mise en évidence d’une éventuelle corrélation entre les différentes bactéries endophytes associées à la Grande ortie et la synthèse des métabolites secondaire, et l’autre sur l’évaluation de l’activité insecticide des extraits de la plante récoltée à Dellys (UDD) et à Tlemcen (UDT) contre les larves de moustique C. pipiens L. Divers bactéries endophytes ont été isolées à partir des tiges, des feuilles et des racines de la Grande ortie en adoptant la méthode décrite par Arnold (1999), Rubini et al. (2005), et El Deeb et al. (2013). L’identification des bactéries endophytes a été effectuée par des examens macroscopiques, microscopiques, biochimiques et confirmée par MALDI-TOF MS. Il s’agit de Bacillus pumilus-ME, Bacillus anthracis, Bacillus megaterium, Bacillus cereus, Escherichia coli, Pantoea agglomerans, Enterobacter amnigenus, Paenibacillus lautus, Paenibacillus glucanolyticus, Staphylococcus cohnii et Enterococcus faecium. Par ailleurs, les tests du screening phytochimique ont fait ressortir une répartition hétérogène des métabolites secondaires dans les différentes parties de la même plante (tiges, feuilles et racines). L’analyse de l’association bactérie-plante a révélé une relation entre la présence de certains endophytes et les métabolites secondaires synthétisés par la plante. En effet, la synthèse des leuco-anthocyanes, saponosides, alcaloïdes, coumarines, glucosides, mucilages, anthocyanes, tanins, tanins catéchiques, sénosides, et flavonoïdes est induite par les bactéries du genre Bacillus. Celle des quinones libres est provoquée par la présence de bactéries du genre Enterococcus, Enterobacter, Staphylococcus et Pantoea. Pour les deux régions, une meilleure activité larvicide effectués sur les larves L2 et L4 de C. pipiens L. a été obtenu pour l’extrait d’UDT (DL50UDD= 8,05 mg/ml, DL50UDT= 6,16 mg/ml après 24h de contact). Par ailleurs, les alcaloïdes d’UDD ont montrés une activité insecticide modérée sur les larves L4 (DL50 alcaloïdes= 6,91 mg/ml après 48h de contact). En revanche, pour les flavonoïdes d’UDT, la meilleure activité insecticide est attribuée à EAE (DL50 EAE= 0,31 mg/ml), suivi de EED (DL50EDD = 0,61 mg/ml), puis EB (DL50 EB= 1,84 mg/ml) et enfin à la fraction EA (DL50 EA= 8,89 mg/ml) (p<0,05). En conclusion, la présente étude suggère que la Grande ortie peut être une source puissante de métabolites secondaires, une niche de plusieurs bactérie endophytes et présente une bonne alternative de lutte biologique, économique et moins nocif sur l’environnement