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Biotechnology-2014 biodegradation performance of phenol by free and alginate entrapped cells of Haloarcula strain D21, an extremely halophilic bacterium isolated from a solar saltern (Ain Salah, Algeria)
(2014) Kebbouche-Gana, Salima; Gana, Mohamed Lamine; Khemili, Souad
Immobilization is a general term that describes many different forms of cell attachment or entrapment. These different forms include encapsulation of cells in a polymer-gel and entrapment in a matrix. The Advantages of these techniques are to reduced possibility of inoculum contamination during storage, transport and application. So, beads are non toxic, biodegradable and non-polluting and can be produced in large quantities, stored for extended periods. Moreover, phenols and phenolic compounds are widely distributed as environmental pollutants due to their common presence in the effluents of many industrial processes, including oil refineries, ceramic plants, coal conversion process, phenolic resins, pharmaceutical and food Industries. The aim of this study was to compare the biodegradation performance of phenol by using free and encapsulated cells of Haloarcula strain D21 isolated from crude oil contaminated saline water collected at Ain Salah in Algeria. Batch experiments were carried out in order to obtain the maximum phenol degradation rates by analyzing the influence of the immobilization in calcium-alginate gel beads on biodegradation performance
Homology modelling and bioinformatics analysis of haloarchaeal α-amylases : an overview of proteins haloadaptation and stability
(2013) Khemili, Souad; Zorgani, Mohamed Amine; Kebbouche-Gana, Salima; Lenchi, Nesrine
Identification de deux archaebactéries halophiles strictes isolées à partir des eaux de gisement de quelques champs pétroliers du sud Algérien et contribution à la caractérisation des biomolécules produites
(2008) Khemili, Souad
Les Bactéries halophiles extrêmes sont prédominantes dans le domaine des Archaea. Elles survivent dans les milieux à très forte concentration en sel (> 1.5M de NaCl). Actuellement, les Halobactéries présentent un grand intérêt grâce à leurs produits bioactives tel que les biosurfactants. Ces derniers ont des applications importantes grâce à leur propriété émulsifiante et activité tension active. Dans le présent travail, nous avons effectué des études microbiologiques, physiologiques et biochimiques des deux souches bactériennes halophiles A et D, leur pouvoir à produire des biopolymères à propriété émulsifiante, ainsi que l'essai de la caractérisation de ces biopolymères. D'après les résultats obtenus, la souche bactérienne A a été rapprochée au genre Halovivax et la souche bactrienne D au genre Haloarcula, au sien de la famille des Halobacteriacaea. Le biopolymère produit peut être un glycoprotéine pour la souche bactérienne A et d'un lipopeptide, glycolipide et /ou glycoprotéine pour la souche bactérienne D
Immunodominant IgE epitopes of Der p 5 allergen
(Bentham Science Publishers, 2018) Lahiani, Sadjia; Dumez, Marie-Eve; Bouaziz, Ahlem; Djenouhat, Kamel; Khemili, Souad; Bitam, Idir; Gilis, Dimitri; Galleni, Moreno
Phenotypic characterization, 16s RNA identification of cultivable on-obligate halophilic bacterial communities from a Tinsilt sebkha, wilaya of Oum El Bouaghi (Algeria) and screening for extracellulars hydrolases and biosurfactants
(2013) Kebbouche-Gana, Salima; Lenchi, Nesrine; Gana, Mohamed Lamine; Khemili, Souad
Prédiction des épitopes B de l'allergène Der p 5 et étude in silico de la structure et de l'état oligomérique des allergènes d'acariens des familles 5 et 21
(2013) Khemili, Souad
Cette recherche s'inscrit dans le cadre de l'étude in silico (en utilisant des approches bioinformatiques et de modélisations moléculaires) des structures 3D des allergènes d'acariens de poussières de maisons des familles 5 et 21. Nous avons pour objectifs de définir les épitopes de Der p 5 et de fournir des informations quant à leur propension à dimériser. Cela contribue à l'étude de leurs mécanismes d’allergénicité et pourrait aboutir à la conception de variants hypoallergéniques pour l'immunothérapie. Quatre régions antigéniques ont été identifiées pour Der p 5: H34-L39 (épitope-Nt), H58-D69 (épitope II), L92-E107 (épitope I) et K129-V132 (épitope-Ct) (selon la numérotation du code PDB 3MQ1 de Der p 5). Par la suite, les résidus situés dans ces régions qui pourraient jouer un rôle crucial dans la liaison aux immunoglobulines E (IgE) ont été sélectionnés selon des critères que nous avons définis (nature des acides aminés et leur accessibilité au solvant) pour la validation expérimentale. Par ailleurs, nous avons étudié la propension des allergènes Der f 5 et Der f 21 de Dermatophagoides farinae, Der p 21 de Dermatophagoides pteronyssinus, Sui 5 m de Suidasia medanensis et Lep d 5 de Lepidoglyphus destructor et Blo t 21 de Blomia tropicalis à dimériser et former une grande cavité hydrophobe similaire à celle de Der p 5. Cette cavité hydrophobe a été suggérée dans la littérature comme pouvant intervenir dans l'initiation du processus allergique en liant certains ligands hydrophobes. Nos résultats suggèrent que seulement Der f 5 pourrait former un dimère semblable à Der p 5. Les autres allergènes (Blo t 5, Sui 5 m, Lep d 5, Der p 21, 21 et Der f Blo t 21) ne présentent pas une telle propension. En outre, nous avons identifié des mutations qui devraient déstabiliser et/ou entraver la formation de la structure dimérique de Derp5, ce qui pourrait aider à la compréhension du rôle du processus de dimérisation dans la réponse allergique de ces allergènes
Production de biosurfactants par Haloarcula sp. souche D21 en conditions salines à partir de milieux de culture à base de lactosérum et des eaux de trempage de maïs (corn steep liquor)
(2012) Kebbouche-Gana, Salima; Khemili, Souad; Lenchi, Nesrine; Akmoussi-Toumi, Siham; Ferioune, I.
Production of biosurfactant on crude date syrup under saline conditions by entrapped cells of Natrialba sp. strain E21, an extremely halophilic bacterium isolated from a solar saltern (Ain Salah, Algeria)
(Springer, 2013) Kebbouche-Gana, Salima; Gana, Mohamed Lamine; Ferrioune, Imen; Khemili, Souad; Lenchi, Nesrine; Akmoussi-Toumi, Siham; Bouanane-Darenfed, Nabila Amel; Djelali, Nacer-Eddine
A bacterial strain E21 was isolated from a sample of water collected in the salt lake located close to Ain Salah, Algeria. The analysis of 16S rRNA gene sequence had indicated that the strain had 93 % sequence similarity with the genus Natrialba sp. strain E21 (Gen- Bank, FR750525.1) and was considered extremely halo- philic. Production of biosurfactant by the strain E21 with free and entrapped cells was investigated using soluble starch in the saline conditions. Biosurfactant synthesis was followed by measuring the surface tension and emulsifying index 9 days under optimal conditions (40 C, pH 7). Some diffusional limitations in alginate and agar beads affected the kinetics of biosurfactant production when compared to that obtained with free cells culture. The minimum values of surface tension were 27 and 30 mN m - 1 achieved after 9 days with free and immobilized cells, respectively, while the corresponding maximum E24 values were 65.3 and 62.3 %, respectively. The re-use of bacterial cells along with the limited cell losses provided by the immobilized system might lead to significant reduction of the biosur- factant production cost
Valorisation de sous produits agroalimentaires pour la production de biosurfactants
(2014) Kebbouche-Gana, Salima; Khemili, Souad; Akmoussi-Toumi, Siham; Lenchi, Nesrine