Etude des populations pathogènes du champignon Pyrenophora.teres : Approche génétique et moléculaire

Abstract

Pyrenophora teres est un champignon pathogène qui cause la rayure réticulée de l’orge. La diversité observée dans les populations de ce pathogène est considérée comme redoutable. La structure des populations et leur dynamique peuvent avoir une grande influence sur le développement de la maladie, d'ou' l'importance de son étude. Les approches génétiques et moléculaires, qui représentent l’utilisation des différentes techniques mises au point pour analyser l’ADN dans le but d’étudier la structure des populations pathogènes de ce champignon ont été abordées dans ce mémoire. Le premier volet décrit le champignon sur le plan morphologique et taxonomique, ainsi que quelques aspects relatifs à la maladie qu’il provoque. Ensuite viennent les domaines où les approches génétiques et moléculaires ont été utilisées ; permettant l’identification de l’espèce, l’étude de leurs génomes, l’identification des mating type, et l’analyse de la diversité génétique. Le dernier volet traite enfin les différentes techniques moléculaires utilisées pour l’étude de la structure des populations pathogènes. L’apport de la bioinformatique dans l’approche génétique et moléculaire dans l’analyse de la structure de la population pathogène a aussi été considéré de façon succincte.