Docking moléculaire de deux molécules bioactives d’origine végétale contre le SARS-CoV-2

Abstract

L'objectif de cette présente étude est de se concentrer sur l'étude in silico pour cribler un médicament alternatif pouvant bloquer l'activité du domaine de liaison au récepteur de pointe SARS-CoV-2 lié au récepteur ACE2, cible thérapeutique potentielle du COVID-19 virus utilisant des composés naturels (gamma terpinène et gamma cadinene),composés d’origine végétale. Dans notre étude, in silico, nous avons suivi la méthode du docking moléculaire en utilisant le logiciel PyRx et le programme CB-DOCK pour étudier les interactions moléculaires, les energies de liaison entre ces molécules et la protéine cible ayant le code PDB (6M0J). Les résultats ont montré que le gamma terpinene avait une bonne affinité à la proteine par rapport au gamma cadinene en utilisant gamma cadinene. Contrairement aux résultats obtenus par CB-DOCK, le gamma cadinene a montré une meilleure affinité. Cette étude est une étude préliminaire, d’autres études sont nécessaire pour confirmer nos résultats et prouver que gamma terpinene et gamma cadinene sont de bon inhibiteurs.